Незважаючи на незаперечну користь плазмаферезу, під час проведення процедури або відразу після її закінчення іноді можуть спостерігатися такі стани:
— емболічні ураження дрібних та великих судин;
— гостра гіповолемія, що виявляється різким зниженням показників артеріального тиску;
— гостра гіперволемія, що характеризується лівошлуночковою гострою недостатністю (задишка, дихальна недостатність, набряк легень);
— геморагічний синдром;
— алергічні реакції різної інтенсивності до анафілактичного шоку;
— пірогенні реакції;
— гіпокальціємія (відчуття оніміння кінцівок, язика, губ).
При цьому частота ускладнень при планових процедурах після проведення всіх підготовчих та діагностичних заходів зводиться до мінімуму.